Hóa sinh trăn

doi. 10. 1002/bmb. 21676. EPub 2022 ngày 12 tháng 9

chi nhánh

  • 1 Trường Hóa học & Khoa học Vật liệu, Viện Công nghệ Rochester, Rochester, New York, Hoa Kỳ
  • 2 Viện Phần mềm Khoa học Phân tử, Blacksburg, Virginia, Hoa Kỳ
  • 3 Khoa Hóa học, Virginia Tech, Blacksburg, Virginia, Hoa Kỳ

Biopython là một bộ công cụ có sẵn miễn phí để tính toán sinh học được viết bằng Python bởi một nhóm các nhà phát triển quốc tế

Đó là một nỗ lực hợp tác phân tán để phát triển các thư viện và ứng dụng Python đáp ứng nhu cầu của công việc hiện tại và tương lai trong tin sinh học. Mã nguồn được cung cấp theo Giấy phép Biopython, cực kỳ tự do và tương thích với hầu hết mọi giấy phép trên thế giới

Chúng tôi là một dự án thành viên của Open Bioinformatics Foundation [OBF], người chăm sóc tên miền và lưu trữ cho danh sách gửi thư của chúng tôi, v.v. OBF được sử dụng để lưu trữ kho lưu trữ phát triển, trình theo dõi vấn đề và trang web của chúng tôi nhưng những thứ này hiện đã có trên GitHub

Chuỗi hướng dẫn này nói về việc tự học ngôn ngữ lập trình Python trong khi thực hiện phân tích dữ liệu

Có thể xảy ra nhầm lẫn để phân biệt giữa ngôn ngữ lập trình Python và các phần mềm Python khác nhau, bao gồm cả các bản phân phối Python [e. g. Anaconda, Ent think, v.v. ] có hoặc không có [các] trình quản lý gói Python [e. g. píp. ]

Phiên bản hiện tại của Python là phiên bản 3. x, nhưng phiên bản 2. x có thể sẽ tồn tại trong một thời gian. Tổ chức Phần mềm Python cuối cùng đã thực hiện bước thông báo chính thức Python 2 sẽ hết hạn sử dụng [EOL] vào ngày 1 tháng 1 năm 2020

Mặc dù đây chưa [chưa] là một phần của hướng dẫn, nhưng người đọc được khuyến khích tìm hiểu về môi trường ảo Python [thật không may một lần nữa, môi trường này sẽ được tạo khác nhau và bằng phần mềm khác nhau tùy thuộc vào bản phân phối Python. [e. g. pipenv, condavirtualenv,  – xem e. g. trại dữ liệu. com, chuyên viên máy tính. tổ chức. ]

Python có hữu ích cho công nghệ sinh học không?

Python bao gồm một số thư viện hữu ích để xử lý dữ liệu sinh học và tạo các công cụ tin sinh học . Mặt khác, Python không nên là ngôn ngữ duy nhất được học cho tin sinh học. Lập trình R, Bash và Perl cũng là những ngôn ngữ tin sinh học hữu ích.

Python có được sử dụng trong sinh học không?

Ứng dụng của Python trong Sinh học . Biopython là một thư viện mã nguồn mở được tạo ra để tính toán trong tin sinh học. it can be used for many more tasks like literature searches, manipulating DNA and protein sequences, and data analysis and visualization. Biopython is an open-source library made for computation in bioinformatics.

Biopython có khác với Python không?

Một đối tượng Biopython Seq tương tự như một chuỗi Python ở nhiều khía cạnh . nó hỗ trợ ký hiệu lát Python, có thể được nối với các chuỗi khác và không thay đổi. Ngoài ra, nó bao gồm các phương pháp cụ thể theo trình tự và chỉ định bảng chữ cái sinh học cụ thể được sử dụng.

Tin sinh học Python là gì?

Biopython là một bộ công cụ có sẵn miễn phí để tính toán sinh học được viết bằng Python bởi một nhóm các nhà phát triển quốc tế . Đó là một nỗ lực hợp tác phân tán để phát triển các thư viện và ứng dụng Python đáp ứng nhu cầu của công việc hiện tại và tương lai trong tin sinh học.

Chủ Đề