MSA2dist tính toán khoảng cách theo cặp giữa tất cả các chuỗi của DNAStringSet hoặc AAStringSet bằng cách sử dụng ma trận điểm tùy chỉnh và tiến hành phân tích dựa trên codon
tin sinh học r dnds-ma trận điểm ước tính dnds gói chất dẫn sinh học liên kết nhiều chuỗi iupac msa2dist kaks
- Cập nhật ngày 8 tháng 11 năm 2022
- C++
bioinfweb / Bộ so sánh căn chỉnh
Sao 1
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Trực quan hóa sự khác biệt giữa nhiều cách sắp xếp trình tự thay thế của cùng một tập dữ liệu
so sánh tin sinh học liên kết nhiều chuỗi
- Cập nhật ngày 1 tháng 2 năm 2019
- Java
ramonnamerong / hladoad
Sao 3
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Một công cụ để tải xuống các alen, epitope và tần số HLA
trình phân tích cú pháp tần số python tải xuống dòng lệnh căn chỉnh dna mhc hla python-module tần số alen alen văn bia epitope liên kết nhiều trình tự
- Cập nhật ngày 5 tháng 12 năm 2022
- con trăn
melyescalona / gacmsa
Sao 0
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
GACMSA. Nhận số lượng Allele từ nhiều tệp Sắp xếp trình tự
tin sinh học fasta allele-counts multi-sequence-alignment
- Cập nhật ngày 8 tháng 12 năm 2017
- con trăn
mcm2020 / trung bình-maxZ-điểm
Sao 0
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Một biện pháp thống kê để đánh giá mức độ đa hình của các trình tự trong sự liên kết nhiều trình tự
tin sinh học tính toán-sinh học nhiều trình tự sắp xếp
- Cập nhật ngày 24 tháng 8 năm 2018
- con trăn
clarkevansteenderen / CBC_Tutorials
Sao 2
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Một bộ sưu tập các bài hướng dẫn về phát sinh loài được gửi đến các đồng nghiệp tại Trung tâm Kiểm soát Sinh học [CBC]. Các chủ đề bao gồm tạo cây Bayesian và Maximum Likelihood, mạng haplotype, đọc phát sinh loài vào R, phân tích dữ liệu ISSR và SSR, đồng thời sử dụng CẤU TRÚC và SplitsTree
cấu trúc dữ liệu nhị phân phát sinh loài aflp mrbayes cipres phân tích đoạn liên kết nhiều chuỗi issr điểm cao nhất garli popart splitstree
- Cập nhậtngày 31 tháng 10 năm 2021
- OpenEdge ABL
mainoc303 / Graph_Genome
Sao 0
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
tin sinh học-biểu đồ bộ gen đường ống biopython-thư viện ngs-liên kết nhiều trình tự đường ống
- Cập nhậtngày 13 tháng 5 năm 2019
- HTML
amaurypm / pseqsid
Sao 8
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Tính toán nhận dạng trình tự theo cặp, độ tương tự và điểm tương tự được chuẩn hóa của protein trong một liên kết nhiều trình tự
nhận dạng tương tự protein-chuỗi nhiều chuỗi liên kết chuẩn hóa-tương tự-điểm
- Cập nhật ngày 1 tháng 7 năm 2022
- rỉ sét
zahrasalarian / Tin sinh học-Mini-Projects
Sao 4
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Một số dự án Tin sinh học nhỏ triển khai các thuật toán liên quan, bao gồm Căn chỉnh bán toàn cầu, Căn chỉnh nhiều trình tự bằng cách sử dụng Căn chỉnh sao và MSA sử dụng cấu hình PSSM có xem xét Khoảng cách
tin sinh học pssm liên kết bán toàn cầu liên kết nhiều trình tự
- Cập nhật ngày 20 tháng 8 năm 2022
- con trăn
rajathpatel23 / dna_sequences_algo
Sao 0
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Phân tích so sánh Thuật toán giải trình tự DNA
prefab shell-script fasta dna-sequences oxbench sắp xếp nhiều trình tự
- Cập nhật 28/12/2020
- Vỏ bọc
matchy-at-ethz / 22hs-comp-bio
Sao 0
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Sinh học tính toán Herbstsemester năm 2022 @ ETHz
gwas tính toán-sinh học phát sinh loài-cây-sắp xếp trình tự-liên kết nhiều trình tự
- Cập nhật ngày 3 tháng 11 năm 2022
bioinfweb / LibrAlign
Sao 0
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Một thư viện GUI Java để hiển thị và chỉnh sửa nhiều sắp xếp trình tự và đính kèm siêu dữ liệu thô và siêu dữ liệu
thư viện gui siêu dữ liệu tin sinh học swing swt sanger-chromatograms gui-components liên kết nhiều chuỗi
- Cập nhật ngày 4 tháng 2 năm 2021
- Java
MDU-PHL / mũi tên
Sao 6
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Trau dồi nhiều sự sắp xếp trình tự của bạn để có được những cây tốt hơn
tin sinh học phylogenetic-cây liên kết nhiều chuỗi
- Cập nhật20 tháng 4 năm 2021
- con trăn
arzwa / pal2cal
Sao 0
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
vâng thực sự
tin sinh học biopython phát sinh loài phát sinh loài đa trình tự liên kết
- Cập nhật04/04/2020
- con trăn
LKremer / MSA_trimmer
Sao 10
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Loại bỏ đơn giản và tối giản các vùng được căn chỉnh kém trong sắp xếp trình tự
phát sinh loài cắt xén codon-liên kết mã-tiến hóa phân tử-liên kết trình tự mã hóa
- Cập nhật18/03/2019
- con trăn
Mahaprabu09 / DailyFiveCodes2-Nov-2022
Sao 0
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
fibonacci-số đệ quy-vấn đề sắp xếp nhiều dãy-sắp xếp-số in-số-chữ số
- Cập nhật ngày 1 tháng 11 năm 2022
- Java
AndreaGuarracino / WFPOA
Sao 7
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Một phần mở rộng cho thuật toán mặt sóng tổng quát hóa nó để hoạt động trên các đồ thị chuỗi tuần hoàn có hướng
căn chỉnh wavefront wfa msa nhiều trình tự căn chỉnh một phần trình tự đồng thuận căn chỉnh thứ tự
- Cập nhật ngày 6 tháng 2 năm 2022
- C
ovaltriangle/dấu vân tay
Sao 0
- Mã số
- Vấn đề
- Yêu cầu kéo
Một chương trình phân luồng nhanh, nhiều luồng cho Sắp xếp nhiều trình tự. Chương trình sử dụng trình tự tham chiếu để có thời gian chạy nhanh hơn